在SNP分型實(shí)驗(yàn)中，選擇正確的技術(shù)平臺(tái)是成功的一半。面對(duì)琳瑯滿目的技術(shù)方法，為何我們最終聚焦于PCR-LDR和基于二代測(cè)序的Hi-SNP這兩大平臺(tái)，并為您提供專項(xiàng)服務(wù)？答案的核心在于：摒棄“萬能"的幻想，追求相應(yīng)的匹配。

一、中低通量研究的利器：PCR-LDR SNP分型服務(wù)

核心原理：多重PCR擴(kuò)增→連接酶區(qū)分SNP（探針僅匹配時(shí)連接）→毛細(xì)管電泳

適用場(chǎng)景：項(xiàng)目需要檢測(cè)的SNP位點(diǎn)較少，樣本量在幾十例。典型應(yīng)用包括：藥物基因組學(xué)核心位點(diǎn)驗(yàn)證、特定通路關(guān)鍵基因多態(tài)性篩查、臨床診斷標(biāo)志物確認(rèn)等。

翼和技術(shù)優(yōu)勢(shì)：

準(zhǔn)確性：自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR為基礎(chǔ)，依靠DNA連接酶對(duì)堿基錯(cuò)配的敏感性，使其LDR分型準(zhǔn)確性遠(yuǎn)超常規(guī)PCR方法，結(jié)果可靠，可用于發(fā)表高水平論文和臨床報(bào)告。

靈活性：可根據(jù)需求靈活設(shè)計(jì)引物，擴(kuò)增目標(biāo)片段，進(jìn)行檢測(cè)。當(dāng)您的研究焦點(diǎn)明確時(shí)，無需為整個(gè)基因組付費(fèi)。單次操作可處理幾個(gè)到上百個(gè)樣本（全自動(dòng)測(cè)序儀一般有8、16、48或96根毛細(xì)管，自動(dòng)上樣）；單次實(shí)驗(yàn)可檢測(cè)多達(dá)20位點(diǎn)的基因型。

成本效益：對(duì)于中低通量項(xiàng)目，該平臺(tái)在試劑和設(shè)備上的投入遠(yuǎn)低于高通量測(cè)序，為您節(jié)約寶貴的科研經(jīng)費(fèi)。

二、高通量研究的引擎：基于二代測(cè)序的Hi-SNP分型服務(wù)

核心原理：對(duì)捕獲區(qū)域進(jìn)行深度測(cè)序，比對(duì)識(shí)別SNP

適用場(chǎng)景：項(xiàng)目規(guī)模宏大，需要檢測(cè)的SNP位點(diǎn)較多，樣本量大。典型應(yīng)用包括：全基因組關(guān)聯(lián)分析、群體遺傳學(xué)研究、多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型構(gòu)建等。

翼和技術(shù)優(yōu)勢(shì)：

高通量：SNP位點(diǎn)30-500個(gè)之間，數(shù)百數(shù)千樣本推薦使用，一次實(shí)驗(yàn)即可獲得海量數(shù)據(jù)，這是任何傳統(tǒng)技術(shù)都沒有的規(guī)模優(yōu)勢(shì)。平均測(cè)序深度1000倍。

“一舉多得"的數(shù)據(jù)產(chǎn)出：不僅能夠?qū)σ阎?/span>SNP進(jìn)行分型，還能對(duì)SNP位點(diǎn)以及周圍序列進(jìn)行測(cè)序，在分析中發(fā)現(xiàn)新的、稀有的遺傳變異，極大拓展了研究的深度和廣度。

規(guī)模化下的低單點(diǎn)成本：當(dāng)位點(diǎn)和樣本數(shù)量足夠大時(shí)，每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的成本具備競(jìng)爭(zhēng)力且保持高檢出率和高準(zhǔn)確率。

三、為何我們專注于此雙平臺(tái)戰(zhàn)略？——對(duì)其他方法的專業(yè)取舍

我們之所以集中資源優(yōu)化這兩個(gè)平臺(tái)，是基于對(duì)技術(shù)優(yōu)劣和客戶需求的深刻理解。以下是我們不將其他方法作為主力服務(wù)平臺(tái)的核心理由：

等位基因特異性PCR：利用PCR引物3’末端的特異性。通量極低，假陽性率高，標(biāo)準(zhǔn)化難。因?yàn)閷?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單、成本低，適合實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部驗(yàn)證個(gè)別位點(diǎn)，但難以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)、多樣本的高效、標(biāo)準(zhǔn)化檢測(cè)，不適合作為商業(yè)化服務(wù)，一些低頻位點(diǎn)快速篩查可以使用。

PCR-RFLP：利用限制性內(nèi)切酶對(duì)特定序列的切割能力。流程繁瑣，通量低，自動(dòng)化程度低，假陽性率高。依賴酶切位點(diǎn)。需要凝膠電泳，步驟多、耗時(shí)長(zhǎng)，易引入人為誤差，無法滿足現(xiàn)代科研對(duì)效率和規(guī)模的要求，只有在預(yù)算極其有限，且對(duì)靈敏度要求不高的情況下，可以作為最初步的、非結(jié)論性的篩查工具。

TaqMan探針法：基于PCR的熒光探針?biāo)馀c熒光信號(hào)檢測(cè)。成本與通量的尷尬區(qū)，在性價(jià)比和靈活性上被LDR和Hi-SNP雙向“夾擊"。優(yōu)勢(shì)是操作簡(jiǎn)單、單樣本單點(diǎn)位快速檢測(cè)，但通量極低，無法同時(shí)檢測(cè)多點(diǎn)位。適用于單點(diǎn)位驗(yàn)證。

基因芯片：將探針固定在芯片上，捕獲樣本DNA。靈活性差，信息量固定。芯片位點(diǎn)是預(yù)先設(shè)定的，無法自由改變。其檢測(cè)范圍限于已知變異，無法發(fā)現(xiàn)新位點(diǎn)。對(duì)于非標(biāo)準(zhǔn)定制需求，芯片成本高昂，通常需要專業(yè)公司服務(wù)。通常用于遺傳病篩查等方向，Hi-SNP則在通量和靈活性上全面超越。

總結(jié)

如果您的研究是“精準(zhǔn)針對(duì)"：目標(biāo)明確，SNP位點(diǎn)和樣本量較少，請(qǐng)選擇我們的PCR-LDR服務(wù)平臺(tái)，進(jìn)行精準(zhǔn)、可靠的驗(yàn)證。它為您提供了最佳的成本控制、高準(zhǔn)確性和快速的交付周期。

如果您的研究是“全景掃描"：需要在大規(guī)模群體中篩選海量的遺傳標(biāo)記，或是探索未知，請(qǐng)選擇我們的Hi-SNP（NGS）服務(wù)平臺(tái)。它將為您打開一扇通往大數(shù)據(jù)研究的大門。