ApoE基因（載脂蛋白E）位于第19號染色體上，具備顯著遺傳多態性，ApoE基因常見的2個單核苷酸多態性為(rs429358和rs7412)；其多態性和多種疾病相關，比如阿爾茨海默病、冠心病、高脂血癥、腦梗死等。進行ApoE基因多態性檢測，可以對這些和其他有關的疾病進行預測。

ApoE 基因位于19號染色體，全長3.7Kb，含4個外顯子。ApoE基因有2個SNP位點rs429358和rs7412，3種等位基因ε2、ε3、ε4，其中以ε3突變常見，相互組合形成6種主要基因型：ε2/ε2、ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4、ε4/ε4。雖然三種ApoE蛋白在一級結構上只有一個氨基殘基的差別，但其空間構象卻存在很大差別，造成ApoE不同的表型在疾病中有著截然不同的影響。

ApoE的基因型終身影響人體的健康和生活方式，它指導個人的飲食習慣，幫助保持良好身體狀況，預防系列重大疾病發生，一旦患病，還決定著與眾不同的個體化治療。

ApoE 基因多態性與冠心病

ApoE4與高總膽固醇（TC）高低密度脂蛋白膽固醇（LDL-C）和高載脂蛋白B（ApoB）水平密切相關。易患動脈硬化、冠心病等。

2014年的一項關于中國人ApoE 基因多態性與冠心病（CHD）相關性的研究中，Zhang, M. D.等對61項研究總計約6634名冠心病患者以及6393名試驗對照進行了分析，結果顯示中國人群中ε4攜帶者患冠心病的風險比ε3/ε3純合基因型高出96%。在各基因型的獨立分析比較中，基因型為ε2/ε4、ε3/ε4、ε4/ε4的人群都被證實比ε3/ε3更易于患冠心病。除此之外，E2基因對中國人冠心病患病影響還與民族有關，非漢族中國人中ε2等位基因可能擁有保護作用。

ApoE 基因多態性與血脂代謝類疾病

動脈粥樣硬化（atherosclerosis，AS）是由遺傳、環境等多因素導致的老年多發性疾病，近年來有逐漸年輕化和上升趨勢。在眾多的發病因素中，脂質代謝紊亂，尤其是高膽固醇血癥與其關系密切。而載脂蛋白E（ApoE）是血漿脂蛋白的重要成分，對脂質的運輸和代謝發揮主要作用。因此，ApoE在動脈粥樣硬化的發生發展中起著關鍵性的作用。1992年由美國洛克菲勒大學生化遺傳與代謝實驗室和北卡羅萊那大學病理遺傳實驗室應用胚胎干細胞基因敲除技術成功培育了ApoE基因敲除小鼠，這種小鼠無論正常或高脂飲食均可形成嚴重的高脂血癥及動脈粥樣硬化。

ApoE 基因多態性與阿爾茲海默氏癥

阿爾茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）是常見的神經退行性疾病，主要病理特征包括β淀粉樣蛋白（β- amyloid，Aβ）組成的老年斑和過度磷酸化蛋白組成的神經元纖維纏結。其發病與ApoE基因多態性有關，大約60%～80%的AD患者有至少一個E4等位基因，國內外研究顯示，攜帶1個E4等位基因使風險增加2～4倍，而擁有2個E4等位基因的人的風險提高8～12倍。與非E4攜帶者相比，E4攜帶者發病年齡平均降低約12歲。因此APOE4攜帶者：AD發病率高，發病年齡早。